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維持蛋白質二級結構的化學鍵是氫鍵。

蛋白質三級結構的形成和穩(wěn)定主要靠次級鍵——疏水作用力、離子鍵、氫鍵和范德華力等。維系四級結構的作用力主要是疏水作用力，

氫鍵和離子鍵也參與維持四級結構。并非所有蛋白質都有四級結構。含有四級結構的蛋白質，單獨的亞基一般沒有生物學功能。

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