藥物在肝臟的主要代謝途徑包括兩個主要階段，即I相反應和II相反應。
1. I相反應主要是氧化、還原或水解等過程。這一階段中最重要的酶系統(tǒng)是細胞色素P450（CYP450）酶系，它參與了大多數(shù)藥物的生物轉化。此外，還有其他一些非微粒體酶如醇脫氫酶和醛脫氫酶也參與到I相反應中。
2. II相反應主要是結合反應，將I相反應生成的代謝產物與葡萄糖醛酸、硫酸、谷胱甘肽等內源性分子相結合，形成水溶性更高的物質以便于排泄。這一階段的關鍵酶包括UDP-葡萄糖醛酸轉移酶（UGT）、磺基轉移酶和N-乙酰轉移酶等。

這兩個階段共同作用使藥物的結構發(fā)生變化，從而影響其藥理活性、毒性和體內清除速度。