多肽鏈形成蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)是一個復雜而有序的過程，主要包括以下幾個步驟：
1. 一級結(jié)構(gòu)：這是指氨基酸通過肽鍵連接形成的線性序列。每種蛋白質(zhì)的一級結(jié)構(gòu)都是特定的，決定著其后續(xù)更高層次的結(jié)構(gòu)。
2. 二級結(jié)構(gòu)：在一級結(jié)構(gòu)的基礎上，由于氫鍵的作用，多肽鏈可以折疊成規(guī)則的局部構(gòu)象，如α-螺旋和β-折疊等。這些構(gòu)象使得多肽鏈具有一定的剛性和穩(wěn)定性。
3. 三級結(jié)構(gòu)：在二級結(jié)構(gòu)的基礎上，蛋白質(zhì)分子中不同部分通過疏水作用、范德華力、靜電相互作用（包括鹽橋）以及二硫鍵等方式進一步折疊成一個特定的空間構(gòu)型。這種三維構(gòu)型對于蛋白質(zhì)的功能至關(guān)重要。
4. 四級結(jié)構(gòu)：有些蛋白質(zhì)由多個多肽鏈組成，這些多肽鏈之間也會發(fā)生上述類似的作用，從而形成更加復雜的四級結(jié)構(gòu)。并非所有蛋白質(zhì)都具有四級結(jié)構(gòu)，這主要取決于其是否為單體或多聚體形式存在。

整個過程中，蛋白質(zhì)的最終構(gòu)象受到多種因素的影響，如pH值、溫度、離子強度等環(huán)境條件的變化都會影響到蛋白質(zhì)的空間結(jié)構(gòu)及其功能表現(xiàn)。