免疫系統(tǒng)能夠區(qū)分自身與非己，主要是通過一系列復雜的識別機制來實現(xiàn)的。首先，人體內的每一個細胞表面都有特定的分子標記，這些標記被稱為主要組織相容性復合體（MHC）分子，在人類中也稱為人類白細胞抗原（HLA）。這些分子就像是細胞的身份證明，告訴免疫系統(tǒng)“我是屬于你的”。

當免疫系統(tǒng)的細胞遇到其他細胞時，它們會檢查這些細胞表面的MHC/HLA分子。如果識別到的是自身細胞上的MHC/HLA分子，則免疫細胞不會發(fā)起攻擊；相反，如果遇到的是外來物質或被病毒感染的細胞等非己成分，其表面上的分子與正常自體細胞不同，免疫系統(tǒng)就會啟動防御反應來清除這些威脅。

此外，T淋巴細胞在胸腺中發(fā)育成熟時會經歷一個選擇過程，只有那些能夠識別自身MHC但不強烈反應于它的T細胞才能存活并參與后續(xù)的免疫應答。這一機制進一步確保了正常情況下免疫系統(tǒng)不會對自身的健康組織造成傷害。

然而，在某些特殊情況下，如自身免疫性疾病的發(fā)生，這種區(qū)分能力可能會出現(xiàn)異常，導致免疫系統(tǒng)錯誤地攻擊自己的組織和器官。