正常菌群和致病菌在口腔環(huán)境中是共存的關(guān)系，但它們之間存在明顯的區(qū)別。首先從定義上來看，正常菌群是指那些長期存在于人體特定部位、與宿主保持共生關(guān)系的微生物群體，對維持機體健康具有重要作用。而致病菌則是指能夠引起疾病的微生物。
1. 生理功能：正常菌群有助于抑制潛在有害細(xì)菌的增長，促進營養(yǎng)物質(zhì)吸收，并參與免疫系統(tǒng)的成熟和發(fā)展。相反，當(dāng)致病菌大量繁殖或入侵非其自然棲息地時，則會導(dǎo)致感染性疾病的發(fā)生。
2. 存在部位：正常情況下，人體口腔內(nèi)的微生物種類相對固定且數(shù)量穩(wěn)定；而某些特定條件（如免疫力下降、環(huán)境變化等）下，一些原本屬于外界的細(xì)菌或者口腔內(nèi)少量存在的致病菌可能會過度生長成為優(yōu)勢種群。
3. 生化特性與遺傳學(xué)特征：通過生化試驗和分子生物學(xué)方法可以對不同細(xì)菌進行鑒定。例如，利用16S rRNA基因測序技術(shù)能夠準(zhǔn)確識別出細(xì)菌種類；同時還可以根據(jù)其代謝產(chǎn)物、酶活性等差異來區(qū)分正常菌群與致病菌。
4. 臨床表現(xiàn)：從臨床上看，如果患者出現(xiàn)口腔潰瘍、牙齦出血等癥狀，并且通過涂片染色或培養(yǎng)發(fā)現(xiàn)有異常的微生物存在，則可能提示為致病菌感染。

在實際工作中，醫(yī)生需要結(jié)合患者的病史、體征以及實驗室檢查結(jié)果綜合判斷是否發(fā)生了由致病菌引起的疾病。同時也要注意維護好口腔內(nèi)的正常菌群平衡，避免濫用抗生素導(dǎo)致耐藥性和生態(tài)失衡問題的發(fā)生。