由水，無機鹽，脂質(zhì)，糖類，核苷酸，氨基酸和多種酶等組成。在細胞質(zhì)基質(zhì)中，進行多種化學反應。

胞質(zhì)溶膠約占細胞總體積55%，其中存在幾千種酶。大多數(shù)中間代謝(包括糖酵解、糖原異生作用以及糖、脂肪酸、核苷酸和氨基酸的合成)都是在胞質(zhì)溶膠中進行的。胞質(zhì)溶膠內(nèi)約20% 是蛋白質(zhì)。許多蛋白質(zhì)可能直接或間接地與細胞骨架相結合，蛋白質(zhì)分子之間也可能有選擇性的親合。因此，細胞質(zhì)基質(zhì)實質(zhì)上是一個在不同層次均有高度組織結構的系統(tǒng)，而不是一種簡單的溶液。然而，在普通透射電子顯微鏡下卻看不到細胞質(zhì)基質(zhì)內(nèi)的有形構造。