《中華人民共和國藥品管理法》第五條規(guī)定：“國務(wù)院藥品監(jiān)督管理部門主管全國藥品監(jiān)督管理工作。國務(wù)院有關(guān)部門在各自的職責(zé)范圍內(nèi)負(fù)責(zé)與藥品有關(guān)的監(jiān)督管理工作。”國務(wù)院的有關(guān)部門主要包括衛(wèi)生行政部門、中醫(yī)藥管理部門、發(fā)展與改革宏觀調(diào)控部門、工商行政管理部門、勞動與社會保障部門、海關(guān)等，它們在國務(wù)院規(guī)定的職責(zé)范圍內(nèi)分別行使《中華人民共和國藥品管理法》規(guī)定的、與藥品有關(guān)事項(xiàng)的監(jiān)督管理工作。

　　1.衛(wèi)生行政部門

　　衛(wèi)生行政部門負(fù)責(zé)審批與吊銷醫(yī)療機(jī)構(gòu)執(zhí)業(yè)證書，負(fù)責(zé)醫(yī)療機(jī)構(gòu)麻醉藥品和精神藥品的管理，負(fù)責(zé)醫(yī)療機(jī)構(gòu)中與實(shí)施藥品不良反應(yīng)報(bào)告制度有關(guān)的管理工作。

　　2.中醫(yī)藥管理部門

　　中醫(yī)藥管理部門負(fù)責(zé)組織中藥及民族藥的發(fā)掘、整理、總結(jié)和提高，負(fù)責(zé)中藥和民族醫(yī)藥的技術(shù)標(biāo)準(zhǔn)的制定、修訂工作。

　　3.發(fā)展與改革宏觀調(diào)控部門

　　發(fā)展與改革宏觀調(diào)控部門負(fù)責(zé)藥品價格的監(jiān)督管理工作。依法醫(yī)學(xué)教育網(wǎng)|收集整理制定和調(diào)整藥品政府定價目錄，并對納入政府定價的藥品進(jìn)行定價和調(diào)整；管理國家藥品儲備；負(fù)責(zé)宏觀醫(yī)藥經(jīng)濟(jì)管理。

　　4.勞動與社會保障部門

　　勞動和社會保障部門負(fù)責(zé)組織擬定基本醫(yī)療保險、生育醫(yī)療的藥品、診療和醫(yī)療服務(wù)設(shè)施的范圍及支付標(biāo)準(zhǔn)；組織擬定定點(diǎn)醫(yī)院、定點(diǎn)藥店的管理辦法及費(fèi)用結(jié)算辦法。

　　5.工商行政管理部門

　　工商行政管理部門負(fù)責(zé)藥品生產(chǎn)、經(jīng)營企業(yè)的工商登記、注冊，以及監(jiān)督管理；藥品廣告監(jiān)管與處罰；藥品流通中各種不正當(dāng)競爭、損害消費(fèi)者利益以及藥品購銷中收受回扣的處罰。

　　6.海關(guān)

　　海關(guān)負(fù)責(zé)藥品進(jìn)口口岸的設(shè)置；藥品進(jìn)口與出口的監(jiān)管。

　　省、自治區(qū)、直轄市人民政府的有關(guān)部門也在各自的職責(zé)范圍內(nèi)負(fù)責(zé)與藥品有關(guān)事項(xiàng)的監(jiān)督