殺菌劑的使用方法有多種，每種使用方法都是根據(jù)病害發(fā)生的規(guī)律設計的。常見的使用方法主要有：對田間地上作物噴藥，土壤消毒和種菌消毒三種。

針對田間作物噴藥，影響殺菌劑田間防病效果的因素也不外乎藥劑、環(huán)境、作物三個方面，但殺菌劑在施用技術上比殺蟲劑和除草劑的施用技術要求更高，尤其要充分了解病害的發(fā)生和發(fā)展規(guī)律，因為病害的發(fā)生和發(fā)展不象蟲害和草害那樣一目了然。對田間農作物噴藥要注意兩點：首先是藥劑的種類和濃度。藥劑種類的選擇決定于病害類型，所以先要作出正確的病害類型診斷，然后才能對癥下藥。如稻瘟病可選稻瘟凈、稻瘟靈、三環(huán)唑等，小麥白粉病、銹病要選三唑醇、三唑酮等，花生葉斑病要選甲基托布津等。但還應注意的是同樣的病若發(fā)生在不同的作物上，有時也不能用同一種藥劑，如波爾多液可防治霜霉病，但易對白菜產生藥害，故不宜防治白菜霜霉病。藥劑的種類選擇后，還要根據(jù)作物種類及生長期、殺菌劑的種類和劑型、環(huán)境條件等選擇合適的施用濃度。