1.肽單元（peptideunit）參與肽鍵的6個(gè)原子——C_α1，C，O，N，H，C_α2位于同一平面，C_α1和C_α2在平面上所處的位置為反式（trans）構(gòu)型，此同一平面上的6個(gè)原子構(gòu)成肽單元。

　　2.模序（motif）在許多蛋白質(zhì)分子中，兩個(gè)或三個(gè)具有二級(jí)結(jié)構(gòu)的肽段，在空間上相互接近，形成一個(gè)具有特殊功能的空間結(jié)構(gòu)。一個(gè)模序總有其特征性的氨基酸序列，醫(yī)學(xué)教育網(wǎng)|收集整理并發(fā)揮特殊的功能，如鋅指結(jié)構(gòu)，α-螺旋-環(huán)-α-螺旋。

　　3.結(jié)構(gòu)域（domain）分子量大的蛋白質(zhì)三級(jí)結(jié)構(gòu)?？煞指畛?個(gè)和數(shù)個(gè)球狀或纖維狀的區(qū)域，折疊得較為緊密，具有獨(dú)立的生物學(xué)功能，稱為結(jié)構(gòu)域。如纖連蛋白含有6個(gè)結(jié)構(gòu)域。