治療胃腸炎最重要的是補(bǔ)充水和電解質(zhì)。通?；颊咧恍枧P床休息并飲用足量的水分（如口服補(bǔ)液鹽溶液）即可。即使是嘔吐的患者也要盡量多飲水。哺乳期的嬰兒應(yīng)繼續(xù)哺乳。碳酸飲料、茶、運(yùn)動(dòng)飲品、含咖啡因的飲料及果汁并不適于補(bǔ)液。如果嘔吐或腹瀉持續(xù)時(shí)間較長(zhǎng)或有嚴(yán)重脫水，有必要進(jìn)行靜脈補(bǔ)液。嘔吐劇烈時(shí)可加用止吐藥。如果腹瀉持續(xù)時(shí)間超過24～48小時(shí)并且沒有跡象表明有更嚴(yán)重的細(xì)菌感染，可加用止瀉藥。通常兒童不建議使用止吐藥和止瀉藥。

由于抗生素可能會(huì)引起腹瀉或促進(jìn)耐藥菌生長(zhǎng)，即使胃腸炎的致病菌已經(jīng)明確醫(yī)學(xué)教|育網(wǎng)搜集整理，抗生素通常也不建議使用。但是，某些病原菌（如彎曲桿菌、志賀菌、霍亂弧菌等）感染或患者有旅行者腹瀉，可使用抗生素。

對(duì)于病毒感染所致的胃腸炎，抗生素并無效果。寄生蟲感染所致胃腸炎需使用抗寄生蟲藥物。