當醫(yī)療機構(gòu)發(fā)現(xiàn)甲類傳染病時，應當立即啟動應急預案，并采取以下措施：
1. 及時報告：醫(yī)療機構(gòu)在發(fā)現(xiàn)甲類傳染病病例后，應該迅速向當?shù)丶膊☆A防控制機構(gòu)和衛(wèi)生行政部門報告疫情情況。
2. 隔離治療：對確診或疑似為甲類傳染病的患者實施隔離治療，防止疾病擴散。同時做好醫(yī)護人員個人防護工作，避免交叉感染。
3. 流行病學調(diào)查：配合疾控部門開展流行病學調(diào)查，追蹤密切接觸者并進行醫(yī)學觀察，必要時采取相應的防控措施。
4. 消毒處理：對可能被污染的環(huán)境、物品等進行徹底消毒，減少病毒傳播風險。
5. 健康教育與宣傳：向患者及其家屬提供正確的健康指導信息，提高公眾自我保護意識和能力。
6. 協(xié)調(diào)資源：合理調(diào)配醫(yī)療資源，確保甲類傳染病患者的及時救治及防控工作的順利開展。