紅花木蓮主要分布于湖南西部城步、新寧、武岡，貴州北部綏陽、江口和東南部凱里、雷山、三都、榕江，廣西全州、龍勝、資源、羅成、融水，云南廣南、富寧、文山、麻栗坡、馬關、金平、紅河、屏邊、蒙自、石屏、元江、新平、峨山、景東、臨滄、滄源、鎮(zhèn)康、鳳慶、龍陵、保山、漾沖、貢山，東南部察隅等地區(qū)。在東部我見于海拔900-1600米，西部可達海拔2600米。尼泊爾、印度東北部、緬甸及越南北部也有分布，屬國家級珍稀瀕危保護植物漸危2級。