阿苯達唑不溶于水，故在腸道內吸收緩慢。原藥在肝臟內轉化為丙硫苯咪唑-亞砜與丙硫苯咪唑-砜，前者為殺蟲成分。本品在體內分布依次為肝、腎、肌肉，可透過血腦屏障，腦組織內也有一定濃度。口服后2.5~3小時血藥濃度達峰值。原藥與砜衍生物在血中的濃度極低，不能測出。而丙硫苯咪唑-亞砜的濃度變化很大，自0.04μg/ml至0.55μg/ml不等，平均0.16μg/ml。血液中半衰期（t1/2）為8.5~10.5小時。本品及其代謝產物在24小時內87%從尿排出，13%從糞便排出，在體內無積蓄作用。