三頭水蜈蚣多年生草本，高8～30厘米。

根莖短。

莖叢生，細弱，扁三棱形，基部呈鱗莖狀膨大，外被棕色，疏散的葉鞘。

葉狹線形，長為莖的一半或等長，寬2～3毫米，邊緣具疏刺。

穗狀花序極稠密，長圓形，淡白色，3個聚生，少數(shù)為1或4～5個；居中者寬圓卵形，較大，長5～6毫米，側生者球形，直徑3～4毫米；葉狀苞片2～3，長于花序；小穗長圓形，長2～2.5毫米，具花1朵；鱗片膜質(zhì)，淡綠黃色，具紅褐色樹脂狀斑點，背面具龍骨突起，脈7條；雄蕊1～3個；花柱短，柱頭2，長于花柱。

小堅果長圓形，稍扁平，長約為鱗片的2／3～3／4，淡棕黃色，具微突起的細點。

抽穗期夏秋季。

生于曠野潮濕處。

分布廣東、廣西。