MRSA分型對(duì)追蹤傳染源、研究型別與感染種類和耐藥性的關(guān)系有重要意義。國外開展較早的有噬菌體分型：將待測菌于肉湯中，35°C孵育6 h，涂布于分型瓊脂平板上，待干后將23種噬菌體注入瓊脂平板中的小方格內(nèi)，再置35°C培養(yǎng)箱孵育，6 h后移至室溫過夜觀察結(jié)果。用4組23種噬菌體，將MRSA分為4群，一般以Ⅰ群為最多[8]，也有報(bào)告以Ⅲ群為多。噬菌體分型結(jié)果常不滿意，日本小粟 子證實(shí)有29.3%菌株不能分型，且重復(fù)性差，不宜用于流行病學(xué)調(diào)查。

質(zhì)粒圖譜分型較為可靠，可分為18個(gè)型，能準(zhǔn)確地分析菌株之間的相關(guān)性，將流行菌株與非流行菌株加以區(qū)別。國內(nèi)MRSA廣泛存在分子量為1.6 Md、1.8 Md及2.67 Md的質(zhì)粒，不同地區(qū)和不同醫(yī)院會(huì)有特殊質(zhì)粒帶。

免疫印跡分型法將MRSA分為9個(gè)型，以B、C型為最常見，各型含有特征性的分子帶，該法比較穩(wěn)定。

染色體限制性內(nèi)切酶分析可識(shí)別病原體DNA鏈上特異位點(diǎn)及核苷酸序列，能從基因水平顯示病原體特征。

MRSA還可用血清學(xué)、凝固酶、耐藥譜等方法分型?，F(xiàn)在Southern印跡法也逐漸運(yùn)用于MRSA的分型。