是將熒光標記的抗體與細胞懸液混合后裝入樣品管內，經熒光染色后通過高速流動系統(tǒng)使細胞排成單行，一個個地流經檢測區(qū)進行測定。當細胞從流動室噴嘴處流出時，經超聲系統(tǒng)振蕩攪動液流，使液流斷裂成一連串均勻小滴，每小滴最多含一個細胞，在激光束照射下產生熒光和散射光，經光電倍增管接收，轉換成脈沖信號，經電腦處理分辨細胞類型。借助光電效應，當小滴通過電場時可出現(xiàn)不同偏向，即可收集到所需類型的細胞。該儀器能以5000個細胞/秒的速度高效分離細胞。FACS是集多項功能于一體的細胞分析儀器，除計數細胞外，還可通過熒光染色檢測細胞表面標記、細胞增殖周期、區(qū)分細胞活性、分選細胞等。