本病是公認的器官特異性自身免疫病。其病因和發(fā)病機制沒有完全清楚，目前認為與下列因素有關：

　　1、體液免疫在多數(shù)患者的血清和甲狀腺組織內含有針對甲狀腺抗原的抗體，已知的主要有甲狀腺球蛋白抗體、甲狀腺微粒體抗體、甲狀腺細胞表面抗體、甲狀腺膠質第二成分等。前兩者具有臨床實用價值。

　　2、細胞免疫患者循環(huán)血中總淋巴細胞和T淋巴細胞增多，刺激產生白細胞移動抑制因子，免疫活性細胞發(fā)生突變，抑制T細胞減少，B細胞失去抑制而更活躍，產生過量的抗體。當抗體醫(yī)學教`育網搜集整理抗原結合時，形成的抗原抗體復合體覆蓋在甲狀腺細胞表面，K細胞與之結合而受到激活。K細胞是一種殺傷淋巴細胞，具有抗體依賴性細胞介導免疫的細胞毒作用，激活后釋出細胞毒，造成甲狀腺細胞的破壞。

　　3、遺傳和免疫監(jiān)護功能缺陷多病例說明同一家族中半數(shù)的同胞兄弟姊妹抗體水平顯著升高，并發(fā)生多起橋本病。血液中抗甲狀腺自身抗體檢出率和滴度高。